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  • 来自专栏Y大宽

    hypothetical protein假设蛋白

    Wiki 在生物学中,hypothetical protein是这样一种蛋白,其存在已经被预测,但是缺乏体内表达的实验证据。 生物信息学工具在基因鉴定过程中,发现一个大的ORF,而这个ORF在蛋白质数据库中并没有同源序列,那么它就会把这个序列归为“hypothetical protein”。 通过把hypothetical protein与已知的家族domains进行比较,可以获得保守结构域,进而可以把这些假设蛋白归类到某一蛋白质家族中,即使它们还没有被体内实验证实。 hypothetical protein的功能也可以通过同源建模进行预测,在这种预测中,假设蛋白要与已知三维结构的蛋白序列进行对齐,并且,通过这种方法,如果结构被预测,那么假设蛋白的功能也可以由计算来确定

    3.8K52发布于 2018-09-30
  • 分子对接PyRasetta--Protein Geometry

    Try to calculate this angle using the xyz atom positions for N, CA, and C of residue A:28 in the protein rosettaimport math# 确保已经初始化pyrosetta.init()# 假设pose已经包含你的蛋白质结构# pose = pyrosetta.pose_from_pdb("your_protein.pdb

    50820编辑于 2025-09-22
  • 来自专栏Ms08067安全实验室

    【HTB靶场系列】靶机Carrier的渗透测试

    今天要实验的是靶机Carrier。 ?

    2.4K20发布于 2019-09-24
  • 来自专栏生物信息云

    研究Protein,这些技术不得不看

    池塘:大肠杆菌或哺乳动物细胞被诱导表达后混合物,目的蛋白(target protein)就在其中。 2. 鱼饵:能特异性吸附蛋白质头部或尾部的蛋白标签(例如HIS组氨酸标签被镍离子吸附) 3. (六)蛋白磷酸化检测-一把车钥匙 技术有:激酶活性分析、磷酸化抗体Western Blot 蛋白质磷酸化(Protein phosphorylation)是调节和控制蛋白质活力和功能的最基本、最普遍,也是最重要的机制 类似于ChIP,研究RNA和蛋白互作 ①RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation),是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,能帮助发现miRNA、lncRNA

    1.2K52发布于 2019-12-13
  • 来自专栏DrugScience

    Protein Imager-漂亮的蛋白作图网页

    Protein Imager 网页: https://3dproteinimaging.com/about-protein-imager/ 前言 好久不见,都快成了月更。 Protein Imager的底层是NGL,你可以在这里进行尝试:https://nglviewer.org/ 特色: (i)性能优异、用户友好、全图形界面; (ii)部署在服务器端且功能齐全的渲染引擎 1r9hYR06V_WZzWFPMoJv5Mw 提取码: 3m8x 复制这段内容后打开百度网盘手机App,操作更方便哦 简单操作步骤: 进入网站 https://3dproteinimaging.com/protein-imager / 输入蛋白 2E4A,随后 fetch 展示界面 展示一些不同的风格作图 风格 1: 风格 2: 风格 3: 风格 4: 膜是随意加的,不具有任何的意义 Protein Imager 自带的图库 : 风格 5: 风格 6: 风格 7: 风格 8: 风格9: 参考文献: Gianluca Tomasello, Ilaria Armenia, Gianluca Molla, The Protein

    1.6K20发布于 2021-12-02
  • 来自专栏bye漫漫求学路

    Convolutional neural network architectures for predicting DNA–protein binding

    CNN用于基因组学研究的最大优势之一是,它可以探测某一motif(指蛋白质分子具有特定功能的或者作为一个独立结构域一部分相近的二级结构聚合体)是否在指定序列窗口内,这种探测能力非常有利于motif的鉴定,进而有助于结合位点的分类

    52810编辑于 2021-12-07
  • 来自专栏Gnep's_Technology_Blog

    GNU Radio之OFDM Carrier Allocator底层C++实现

    一、OFDM Carrier Allocator 简介 OFDM Carrier Allocator:OFDM 子载波分配模块,也即串并转换模块。 1、make 函数 ofdm_carrier_allocator_cvc::sptr ofdm_carrier_allocator_cvc::make( int fft_len, const 智能指针 返回值是 ofdm_carrier_allocator_cvc::sptr,即指向 ofdm_carrier_allocator_cvc 的智能指针。 ofdm_carrier_allocator_cvc_impl::ofdm_carrier_allocator_cvc_impl( // 参数说明: int fft_len, ofdm_carrier_allocator_cvc_impl::~ofdm_carrier_allocator_cvc_impl() {} 三、OFDM 数据格式 经过子载波分配模块和 IFFT 后的

    74320编辑于 2024-03-28
  • 一文读懂PDB格式 protein database bank

    最近在做分子对接和分子模拟,涉及到了一些盲区,必去pdb文件是按照列位数储存信息的,跟其他文件的空格或者制表符分割很不同,所以也可能出现一些错误,比如信息错位,因此有必要了深入解下结构相关的格式pdb、cif、sdf等等

    1.2K10编辑于 2025-08-14
  • 来自专栏蛋白表达与生物实验技术

    CRM197白喉毒素无毒突变体在疫苗与生物医药研究中的应用

    三、CRM197重组蛋白的表达与制备在实验研究中,CRM197通常通过重组蛋白表达系统进行生产。典型实验流程包括:1.基因构建将CRM197编码序列克隆至表达载体,并进行质粒扩增和纯化。 3.新型疫苗开发在现代疫苗研究中,CRM197常用于:多肽疫苗合成疫苗糖结合疫苗五、CRM197蛋白研究应用示意图1:CRM197白喉毒素突变体结构示意图2:CRM197载体蛋白在疫苗研究中的应用示意六 、CRM197研究价值作为一种白喉毒素无毒突变体,CRM197在免疫学研究中具有重要意义:保持天然蛋白结构具有良好免疫原性无毒性易于进行重组表达因此CRM197载体蛋白在疫苗研发、生物医药研究以及免疫学研究中具有广泛应用 FAQ什么是CRM197蛋白?CRM197是一种来源于Diphtheriatoxin的单点突变体,属于白喉毒素无毒突变体,失去毒性但保持免疫原性。CRM197为什么常被用作载体蛋白? 由于CRM197具有较强的免疫原性,因此常被用于提高多糖抗原或小分子抗原的免疫反应。CRM197与TT或DT有什么区别?

    10220编辑于 2026-03-12
  • 来自专栏CRM197载体蛋白

    CRM197载体蛋白在偶联疫苗研究中的作用

    随着重组蛋白表达技术的发展,重组CRM197蛋白(RecombinantCRM197)已成为疫苗研发中常见的载体蛋白crm197。 一、CRM197蛋白的结构特点CRM197蛋白与天然白喉毒素具有高度相似的三维结构,但由于关键位点突变而失去毒性。 三、CRM197重组蛋白的表达在实验研究中,CRM197通常通过重组表达系统生产。典型流程包括:1DNA构建将CRM197基因克隆至表达载体,并进行质粒扩增。 四、CRM197在疫苗研发中的应用由于CRM197具有稳定结构和良好的免疫原性,因此在多种疫苗研究中被广泛应用。 五、CRM197研究应用示意图1:CRM197白喉毒素突变体结构示意图2:CRM197载体蛋白在疫苗研究中的应用示意FAQ什么是CRM197蛋白?

    10910编辑于 2026-03-12
  • 来自专栏CRM197载体蛋白

    CRM197是什么?白喉毒素无毒突变体在疫苗研发中的作用

    CRM197蛋白具有以下特点:来源于白喉毒素突变体不具有毒性保持稳定结构具有良好的免疫原性由于这些特点,CRM197常被用作载体蛋白crm197(crm197carrierprotein),用于提高抗原的免疫反应 二、CRM197蛋白结构特点CRM197蛋白的分子量约为58kDa,其结构与天然白喉毒素高度相似,但由于关键突变而失去毒性。 四、CRM197重组蛋白的研究应用随着重组蛋白技术的发展,重组CRM197已被广泛应用于疫苗研究和生物医药研究,例如:多糖结合疫苗研究抗原递送系统研究免疫原性研究新型疫苗开发在现代疫苗研发中,CRM197 五、CRM197蛋白研究示意图1:CRM197白喉毒素无毒突变体结构示意图2:CRM197载体蛋白在疫苗研究中的应用FAQCRM197是什么蛋白? 由于CRM197具有良好的免疫原性和稳定结构,因此常被用于增强抗原的免疫反应。CRM197与TT或DT有什么区别?

    12610编辑于 2026-03-12
  • 来自专栏CRM197载体蛋白

    TT、DT 与 CRM197 载体蛋白有什么区别?疫苗研发中的常见载体蛋白解析

    随着重组蛋白技术的发展,CRM197重组蛋白逐渐成为疫苗研究中广泛应用的一种载体蛋白。本文将介绍TT、DT与CRM197载体蛋白的主要特点以及在疫苗研究中的应用。 六、CRM197载体蛋白的研究应用CRM197在疫苗研发中具有重要作用,其主要应用包括:多糖结合疫苗小分子抗原偶联新型疫苗研究抗原递送系统研究通过与抗原偶联,crm197载体蛋白可以显著提高免疫反应强度 七、CRM197蛋白研究示意图1:CRM197白喉毒素突变体结构示意图2:CRM197载体蛋白在疫苗研究中的应用示意FAQCRM197是什么蛋白? 由于CRM197具有良好的免疫原性和稳定结构,因此常被用于增强抗原的免疫反应。CRM197重组蛋白可以用于哪些研究? CRM197重组蛋白常用于:偶联疫苗研究免疫原性研究抗原递送系统研究总结TT、DT和CRM197都是疫苗研发中常见的载体蛋白。

    11510编辑于 2026-03-12
  • 来自专栏生信札记

    插件 | 蛋白序列集合功能注释快速完成 - Quick Protein Anno

    Quick Protein Anno 安装请参考之前的推文《Plugin | 高速版插件商店!我又有一个绝妙的 idea》。

    1.4K10发布于 2021-03-14
  • 来自专栏Sentieon:文献解读

    文献解读-Pathogenic variants carrier screening in New Brunswick: Acadians reveal hig

    文献介绍标题(英文):Pathogenic variants carrier screening in New Brunswick: Acadians reveal high carrier frequency

    21110编辑于 2025-01-22
  • 来自专栏R语言交流中心

    特别栏目之新型冠状病毒(2019-nCoV)序列与人类基因相似性分析

    family member A (SIN3A), RefSeqGene on chromosome 15 0.8077 NG_052855.1 Homo sapiens nucleotide binding protein membrane peptidase subunit 2 (IMMP2L), RefSeqGene on chromosome 7 0.8182 NG_030016.2 Homo sapiens solute carrier 43 (SLC25A43), RefSeqGene on chromosome X 0.8421 NG_016298.2 Homo sapiens parkin RBR E3 ubiquitin protein ligase (PRKN), RefSeqGene on chromosome 6 0.8222 NG_008289.2 Homo sapiens Ral GTPase activating protein Homo sapiens keratin 14 (KRT14), RefSeqGene on chromosome 17 0.875 NG_008624.1 Homo sapiens solute carrier

    1.6K10发布于 2020-02-25
  • 来自专栏赵化冰的技术博客

    LFN ONAP Beijing Release Developer Forum: MSB to Support Carrier Grade ONAP Microservice Architectur

    discuss the OMSA(ONAP Microservice Architecture): the vision of ONAP Microservice Architecture to support Carrier-Grade

    41110编辑于 2022-08-01
  • 来自专栏DrugOne

    奥地利科学院博后招聘Multimodal ML for protein and tissue dynamics

    奥地利科学院博后招聘Multimodal ML for protein and tissue dynamics We invite outstanding candidates to apply for chemical perturbations to identify potential therapeutic targets for disease-associated changes in protein Tissue-specific protein localization and interaction. Protein subcellular localization and protein-protein interactions (PPIs) are essential to many biological We develop computational models that predict protein localization and interactions with single-cell and

    11910编辑于 2025-11-17
  • 来自专栏生信技能树

    为什么一个基因可以既是lncRNA又是protein_coding

    有意思的是学生们给我反馈了有几个基因居然既是lncRNA又是protein_coding。 ENSG00000166897 chr22 37367960 37427479 我随手查了一下,这个ELFN2基因,居然真的既是lncRNA又是protein_coding,可是我再认真看的时候, SMIM40 protein_coding ENSG00000285064 chr6 33321386 33329286 SMIM40 protein_coding ENSG00000286920 chr6 queryString=ENSG00000243902 (数据库 :Lnc-ELFN2-2 ) 可以看到,之所以这个ELFN2基因既是lncRNA又是protein_coding,其实是因为数据库ID 其实我都不知道这个问题算不算生物学问题,就是有没有真的一个基因它就既是lncRNA又是protein_coding,但并不是这种数据库ID匹配的失误造成的,而是它基因真实的特性呢?

    1.8K52发布于 2021-02-04
  • 来自专栏百味科研芝士

    miRTissue:一款miRNA-target-protein相互关系分析的神器

    所以,今天小编打算给小伙伴们分享一个miRNAs相关的网站——miRTissue,这个网站主要分析miRNA-target-protein的相互关系,它的数据来源于TCGA。 横向的是2种分析方式,包括: >Normal/Tumor miRNA-target analysis正常组织/肿瘤组织的miRNA靶点分析 >miRNA-target-protein analysis 分析 独立情景1 具体肿瘤miRNA-基因-蛋白质相互作用分析 点击“miRNA-target-protein analysis for a specific tumor type”,比如我们分析miRNA

    1.1K10发布于 2019-05-23
  • 来自专栏生信技能树

    铁死亡这个国自然热点到底有哪些基因都没有搞清楚

    [2] "Slc3a2; solute carrier [4] "Slc7a11; solute carrier [6] "Trp53; transformation related protein 2 [KO:K06519]" [3] "23657" [4] "SLC7A11; solute carrier member 11 [KO:K13869]" [5] "7157" [6] "TP53; tumor protein

    75900编辑于 2024-11-28
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